MSDD-D ml
| # | Utkání | Zápasů | Výher | Remíz | Proher | Skóre | Body | Rozdíl +/- |
| 1 | FKM Vysočina Jihlava | 30 | 29 | 0 | 1 | 244 : 10 | 87 | |
| 2 | 1. SK Prostějov B | 30 | 23 | 2 | 5 | 148 : 43 | 71 | |
| 3 | FC Boskovice - Letovice | 30 | 20 | 2 | 8 | 113 : 74 | 62 | |
| 4 | SK Líšeň B | 30 | 18 | 6 | 6 | 162 : 47 | 60 | |
| 5 | FK Hodonín | 30 | 15 | 8 | 7 | 84 : 59 | 53 | |
| 6 | MFK Vyškov | 29 | 16 | 3 | 10 | 70 : 73 | 51 | |
| 7 | FC Slovan Havlíčkův Brod | 30 | 15 | 5 | 10 | 88 : 62 | 50 | |
| 8 | 1. SC Znojmo B | 30 | 15 | 4 | 11 | 81 : 72 | 49 | |
| 9 | TJ Sokol Bedřichov | 30 | 14 | 5 | 11 | 80 : 87 | 47 | |
| 10 | FC Kuřim | 30 | 12 | 2 | 16 | 75 : 82 | 38 | |
| 11 | FC Žďas Žďár nad Sázavou | 30 | 11 | 2 | 17 | 69 : 111 | 35 | |
| 12 | SK Fotbalová škola Třebíč | 30 | 11 | 1 | 18 | 107 : 127 | 34 | |
| 13 | FK Maraton Pelhřimov | 30 | 4 | 4 | 22 | 49 : 133 | 16 | |
| 14 | FK Blansko | 30 | 4 | 2 | 24 | 46 : 206 | 14 | |
| 15 | ČAFC Židenice | 30 | 3 | 5 | 22 | 36 : 145 | 14 | |
| 16 | FC Slovan Rosice | 29 | 3 | 1 | 25 | 36 : 157 | 10 |